1. Bo Kojima (albo inny geniusz w ekipie) uznał, że bandaże to magiczne urządzenie, pod którym może być WSZYSTKO. Cała tłusta szopa i gęsta broda Big Bossa także.
1A. Uznał też, że nie ma co się przyglądać czy oczy całe czy nie. Ale BB może mieć równie dobrze szklane oko albo mieć swoje ślepe oko wyglądające normalnie. Nie stracił gałki ocznej, został tylko na to oko oślepiony, zniszczona rogówka. Paramedic mówiła. I ja też już mówiłem w sąsiednim temacie, ze dwa razy :^)
2. Niewyjaśnione, mogli się pomylić, albo Kojima już sam się zaplątał. Bez znaczenia obecnie.
3. Atak XOF miał na celu zlikwidowanie Big Bossa, bo to o jego przebudzeniu się dowiedzieli dzięki paranormalnym pojebaństwom Mantisa i Volgina. A to, czy Quiet na miejscu poznaje, kto jest Schab a kto Beszamel... cholera wie, to jest jedna rzecz, która w serii nigdy nie była jednoznaczna - jak "ogarniają" się postacie nawzajem. Raz komuś uchodzi udawanie kompletnie innej osoby, mimo że my idealnie wiemy, że to nie on, innym razem ktoś udaje że kimś nie jest a dla nas jest oczywiste, że jest. Solidus wielu przekonał do tego, że jest Solid Snakiem, Solid Snake jako Iroquois Pliskin nie został zdemaskowany przez kompletnie nikogo, dopóki sam się nie ujawnił. My gracze zawsze mamy swoje zdanie, co jest oczywiste a co nie, ale nigdy nie wiemy, czy jedna postać w grze przejrzała przez przebranie drugiej. Przecież w MGS 4 wszyscy myśleli, że Ocelot to Liquid. Tak czy siak, celem ataku był Big Boss, nie wiem czy XOF/Skull Face kiedykolwiek dowiadują się o intrydze z sobowtórem.
4. Operacja strun głosowych. Już wcześniej mieli podobny głos (technicznie Masywny Medyk w GZ miał głos także Kiefera Sutherlanda, ale obniżony). Podobnie zresztą z twarzą... OK, niby możesz sobie avatara ustawić totalnie jakiego chcesz, ale jeżeli twarz Medyka w GZ ma jakiekolwiek znaczenie, to możemy uznać, że i przed operacją byli mocno podobni do siebie.

Albo to, albo ta "twarz Medyka" to placeholder, którego używali, kiedy teoretycznie NIE mieliśmy nigdy widzieć jego twarzy. Bo właśnie w TPP wykorzystali ten sam model twarzy/głowy dla Ishmaela pod bandażami. Tyle że my nigdy nie mieliśmy się przyglądać, co jest pod spodem, więc to nie jest wiążące.

Tak czy inaczej, podobieństwo jest ogromne, na jednym ze zdjęć to widać - na tym, na którym patrzy przez ramię. Dodasz brodę i masz Dużego Dowódcę.
Poza tym FOX Engine to przede wszystkim gra światła. Post factum widzimy, że Ishmael wygląda jakby miał sprawne oczy, jakby nie miał brody pod bandażami i w ogóle, ale oryginalnie w grze światło jest takie, że nie mamy szans wyciągać aż tak daleko idących wniosków (no dobra, broda...). Bez gry świateł i cieni już trudniej dostrzec to podobieństwo:
